10月12日，中国民用航空局（以下简称民航局）在其官网上发布了事件通告，初步判断，该事件是一起因塔台管制员指挥失误造成跑道侵入的不安全事件。
10月18日，针对该事件最新进展，中国民用航空华东地区管理局（以下称民航华东局）相关人士向《每日经济新闻》记者透露，民航局关于10月11日上海虹桥机场跑道入侵事件的调查已经结束。而对于公众关心的处罚结果问题，该人士表示，由于此事目前由民航局在负责，民航华东局只是辅助协助，因此具体处罚何时做出其并不知情。
10月16日时，多家媒体称，虹桥10.11事件初步处罚结果为：当班管制员事后曾给330机长打电话要求瞒报，已经三停；上海虹桥机场塔台所有领导就地免职、转岗，虹桥塔台现在由空管中心代管。对此消息，上述民航华东局人士予以了否认。此外，民航局还拒绝了记者通过民航华东局转达的采访要求。
《每日经济新闻》记者了解到，对于起飞落地的飞机，就算全球最先进的机场，也会使用肉眼或者望远镜观察，飞机在地面滑行的数据也不是所有的机场都有地面跟踪监控雷达，能报告所有飞机动态。
国内一位飞行员还告诉记者，目前国内机场导航台、机场、管制员数量都不太够，“空中同一时段hold不住那么多飞机，而且地面设施不够，很多明明可以两点一线的航路最后都被迫曲折迂回，每一架飞机在空中的时间更长了，自然也会更拥堵忙碌”。
事实上，虹桥机场此次事件与1977年特内里费空难极为相似，当年，一架荷兰皇家航空的波音747- 206B客机KL4805与一架美国泛美航空的波音747-121客机PA1736在机场相撞，共583人死亡。
